Va ser fundat en 1607 a sol·licitud de Pere Santandreu, guardià del convent de sant Francesc de Palma, nascut a Petra.
En 1609 ja s'havia construït un petit temple, l'espai del qual correspon a l'actual capella del Betlem. A causa del bon acolliment per part del poble, en 1657 es va començar a edificar un nou temple major baix la direcció del mestre Rafel Poquet finalitzant en 1677.
Aquí, Fra Juníper Serra va començar els seus estudis, de fet els noms que posà a les missions que va fundar estan relacionats amb la majoria de les advocacions de les capelles que l'església alberga com la ciutat de Los Ángeles o la de San Francisco.
Amb la desamortització (1836) la comunitat de franciscans fou exclaustrada i el convent va ser dividit en recintes per ser venut. En 1969, els franciscans van tornar al convent de unes dimensions menors que tenia abans de la desamortització.
L'església és d'estil renaixentista amb planta basilical d'una sola nau amb volta de canó i sis capelles laterals a cada costat que alberguen retaules barrocs elaborats entre finals del segle XVII i primera meitat del segle XVIII. Els retaules més destacats són el retaule Major, el del Sant Crist, el de la Verge dels Àngels i el de Sant Francesc.
La capella del Betlem destaca per contenir figures d’època gòtica (els àngels) pertanyents a l'antic pessebre que hi havia al convent de Jesús de Palma. El paviment de la capella està més baix que el de les altres i està coberta per una volta de canó rebaixada com si fora una cova.
El convent alberga dues sales on s'exposen mobiliari i objectes litúrgics antics, objectes relacionats amb la vida de Fra Juníper Serra i una sèrie de pintures de pasta de vidre que representen passatges de la vida del Pare Serra.
La façana principal situada al carrer major conserva un portal d'arc de mig punt i volta cassetonada. Als laterals es troben dues fornícules on estarien les desaparegudes imatges dels sants franciscans.
Direcció: Carrer des Convent
Horari visita (entrada per la placeta de ses Convent):
De Dilluns a Dissabte 10:00-12:30 // 16:00-17:30
Diumenges 10:00-11:00
